Bộ Chỉ Huy BĐBP tỉnh Quảng Ninh tập trung lãnh đạo quán triệt, cụ thể hóa chủ trương, đường lối của Đảng, chính sách pháp luật của Nhà nước, các chỉ thị, nghị quyết, mệnh lệnh của Quân ủy Trung ương, Bộ Quốc phòng, Bộ Tư lệnh Bộ đội Biên phòng, Tỉnh ủy, UBND tỉnh Quảng Ninh là nhiệm vụ quân sự quốc phòng trọng tâm. Qua đó Bộ Chỉ huy BĐBP tỉnh cũng đã chỉ đạo các đơn vị xác định nhiệm vụ quan trọng là chủ động ứng phó với thiên tai và cứu hộ cứu nạn kịp thời. Đặc biệt là tăng cường tuyên truyền cho nhân dân không khai thác thủy hải sản trái quy định.