Theo kết luận của cơ quan thuế, doanh nghiệp đã kê khai khấu trừ thuế GTGT đầu vào dựa trên hóa đơn mua hàng hóa, dịch vụ của các doanh nghiệp không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký kinh doanh. Đồng thời, công ty thực hiện phân bổ thuế GTGT đầu vào dùng chung theo tỷ lệ doanh thu không chịu thuế trên tổng doanh thu chưa đúng quy định.
Ngoài ra, Tổng Công ty Thăng Long còn kê khai thuế GTGT đầu ra không đúng thời điểm khi xuất hóa đơn nghiệm thu công trình xây lắp. Doanh nghiệp cũng hạch toán thiếu doanh thu và giá vốn tương ứng do ghi nhận sai thời điểm nghiệm thu công trình.
Cơ quan thuế cũng xác định doanh nghiệp hạch toán chi phí sản xuất kinh doanh từ hóa đơn của các đơn vị không hoạt động tại địa chỉ đăng ký và thực hiện trích lập dự phòng khoản phải thu khó đòi nhưng chưa đầy đủ hồ sơ, căn cứ theo quy định.
Với các vi phạm trên, Tổng Công ty Thăng Long bị xử phạt hành chính gần 94,3 triệu đồng. Đồng thời, doanh nghiệp bị truy thu gần 239 triệu đồng tiền thuế thu nhập doanh nghiệp và phải nộp tiền chậm nộp gần 48,9 triệu đồng, tính đến hết ngày 10/2/2026.
Như vậy, tổng số tiền truy thu, tiền phạt và tiền chậm nộp mà doanh nghiệp phải nộp vào ngân sách nhà nước là hơn 382,1 triệu đồng. Ngoài ra, công ty còn bị buộc điều chỉnh giảm số thuế GTGT còn được khấu trừ chuyển kỳ sau gần 1,7 tỷ đồng.
Theo quy định, Tổng Công ty Thăng Long có trách nhiệm tự tính và tiếp tục nộp tiền chậm nộp phát sinh sau ngày 10/2/2026 cho đến khi hoàn thành đầy đủ nghĩa vụ với ngân sách nhà nước.
Tổng Công ty Thăng Long tiền thân là Xí nghiệp Liên hợp Cầu Thăng Long, được thành lập năm 1973, hiện hoạt động chủ yếu trong lĩnh vực xây dựng hạ tầng giao thông, hạ tầng khu công nghiệp, sản xuất bê tông và cho thuê kho bãi, nhà xưởng, văn phòng.
H.M
