Cụ thể, ngày 10/10/2012, UBND tỉnh có Quyết định số 1331/QĐ-UBND về thanh tra việc thực hiện chính sách pháp luật của Công ty CP Hà Hoa Tiên tại xã Hoàng Đông, huyện Duy Tiên, tỉnh Hà Nam.
Thực hiện theo quyết định này, ngày 2/1/2013, Đoàn thanh tra liên ngành có Báo cáo kết quả thanh tra số 01/BC-ĐTTr. Ngày 6/2/2013, UBND tỉnh có Kết luận số 205/KL-UBND thanh tra việc thực hiện chính sách pháp luật của Công ty CP Hà Hoa Tiên.
Theo kết luận của UBND tỉnh, Công ty CP Hà Hoa Tiên nộp thuế theo phương án khấu trừ thuế, việc hoàn thuế đối với Công ty CP Hà Hoa Tiên, tính đến trước thời điểm tháng 9/2007 là đúng quy định. Vì thời điểm này, Công ty CP Hà Hoa Tiên chưa phát sinh thuế đầu ra. Mặt khác, cũng chưa có dự án Trường Đại học Hà Hoa Tiên, không thuộc đối tượng chịu thuế giá trị gia tăng.
Tuy nhiên, khi dự án Trường Đại học Hà Hoa Tiên được thành lập, Công ty CP Hà Hoa Tiên đã không kê khai, hoàn trả số tiền thuế đã được hoàn đối với dự án này, mà chiếm đoạt, sử dụng từ năm 2007 đến nay (thời điểm thanh tra).
Theo Cục Thuế tỉnh Hà Nam, kể từ khi thành lập Trường Đại học Hà Hoa Tiên chưa thực hiện nộp tiền thuê đất với ngân sách Nhà nước.
Theo thanh tra tỉnh Hà Nam, quá trình thanh tra tại đơn vị, Công ty CP Hà Hoa Tiên đã không cung cấp các tài liệu liên quan tới các chi phí đầu tư xây dựng cơ sở hạ tầng. Vì vậy, đoàn thanh tra liên ngành (Cục Thuế tỉnh là thành viên của đoàn) căn cứ Điều 36, Điều 37 Luật Quản lý thuế số 78/2006/QH11 ngày 29/11/2006 của Quốc hội đã ấn định số thuế giá trị gia tăng mà Công ty CP Hà Hoa Tiên phải nộp là 6.298.565.997 đồng, dựa trên cơ sở diện tích đất sử dụng của dự án.
Kết luận thanh tra của UBND tỉnh đã giao Cục Thuế tỉnh Hà Nam tiếp tục kiểm tra, rà soát việc thực hiện chính sách pháp luật về thuế, để xác định chính xác các nghĩa vụ nộp ngân sách Nhà nước đối với Công ty CP Hà Hoa Tiên tại Cụm Công nghiệp Hoàng Đông, huyện Duy Tiên, tỉnh Hà Nam.
Ngày 7/2/2013, thực hiện chỉ đạo của UBND tỉnh, Chánh Thanh tra tỉnh Hà Nam đã ban hành Quyết định số 14/QĐ-TTr thu hồi số tiền sai phạm trên của Công ty CP Hà Hoa Tiên về tài khoản tạm giữ của Thanh tra tỉnh.
Tuy nhiên, sau thời điểm kết luận thanh tra được ban hành, Thanh tra tỉnh đã nhiều lần có công văn đôn đốc, nhưng Công ty CP Hà Hoa Tiên vẫn không thực hiện nộp số tiền trên về ngân sách Nhà nước.
Trước sự việc này, thực hiện quy chế phối hợp số 01/LN-QCPH ngày 8/1/2008 giữa các cơ quan: Viện Kiểm sát, Công an, Thanh tra, Cục thuế, Chi cục Kiểm lâm, Chi cục Quản lý thị trường trong công tác tiếp nhận, quản lý và giải quyết tố giác, tin báo về tội phạm, Chánh Thanh tra tỉnh Lại Văn Hải đã ký Văn bản số 294/TTr ngày 21/11/2013 báo tin cho VKSND tỉnh Hà Nam về sai phạm nghiêm trọng của Công ty CP Hà Hoa Tiên liên quan đến thuế.
Văn bản số 294/TTr do Chánh Thanh tra tỉnh Lại Văn Hải ký, nêu rõ, Thanh tra tỉnh báo tin để Viện Kiểm sát nhân dân tỉnh được biết và phối hợp xử lý theo quy định của pháp luật.
Năm 2018, Trường Đại học Hà Hoa Tiên cũng dẫn đầu danh sách nợ thuế với hơn 23 tỷ đồng.
Trước đó, Thương hiệu và Công luận đã thông tin, theo số liệu được Cục Thuế Hà Nam thống kê, báo cáo UBND tỉnh Hà Nam, tính đến thời điểm ngày 31/8/2019, Công ty CP Hà Hoa Tiên và Đại học Hà Hoa Tiên vẫn chưa nộp về ngân sách Nhà nước số tiền khoảng 31 tỷ đồng và 640.639 USD…
Cụ thể, về tiền thuê đất, tổng số tiền thuế, phí, lệ phí... Công ty Cổ phần Hà Hoa Tiên nộp vào ngân sách Nhà nước kể từ khi thành lập đến ngày 31/8/2019 là 1.448.346.755 đồng.
Trong đó, riêng tiền thuê đất tính đến hết tháng 8/2019, Công ty Cổ phần này phải nộp số tiền thuê đất là 6.214.143.000 đồng và 650.474 USD. Công ty đã nộp 213.723.043 đồng, tương đương 9.835 USD. Như vậy, Công ty Cổ phần Hà Hoa Tiên còn phải nộp số tiền thuê đất là 6.214.143.000 đồng và 640.639 USD (chưa bao gồm số tiền chậm nộp).
Đối với Đại học Hà Hoa Tiên, về lệ phí trước bạ nhà, đất, số liệu được Cục Thuế Hà Nam thống kê, tính đến ngày 31/8/2019 là 62.196.366 đồng. Tiền thuê đất, thuế sử dụng đất phi nông nghiệp, tổng số tiền thuế, phí, lệ phí... trường này đã nộp vào ngân sách Nhà nước kể từ khi thành lập đến hết ngày 28/8/2019 là 1.695.703.006 đồng.
Năm 2019, Đại học Hà Hoa Tiên thuộc diện phải điều chỉnh đơn giá thuê đất, tuy nhiên, hiện tại vẫn chưa có phương án điều chỉnh đơn giá thuê đất nên cơ quan thuế chưa tính và chưa ban hành thông báo tiền thuê đất phải nộp năm 2019.
Theo đó, số tiền thuê đất Trường Đại học Hà Hoa Tiên phải nộp tính đến hết tháng 12/2018 là 25.249.995.200 đồng (chưa bao gồm số tiền chậm nộp). Kể từ khi thành lập Trường Đại học Hà Hoa Tiên chưa thực hiện nộp tiền thuê đất với ngân sách Nhà nước.
Thương hiệu và Công luận sẽ tiếp tục thông tin về vụ việc.
Tuấn Ngọc